بخش تحقیقات گیاهپزشکی:

         برنامه های بررسی آفات پنبه و روشهای مختلف کنترل آنها در این بخش انجام می پذیرد. از آفات مهم پنبه ایران می توان به کرم قوزه،کرم خاردار، کرم برگخوار،کارادرینا، عسلک، شته، کنه، تریپس و به بیماریهای پژمردگی، ورتیسیلیوم ، فوزاریوم و مرگ گیاهچه اشاره نمود. در این بخش تحقیقات بر روی سموم آفت کش و مقاومت آفات به آفت کش ها و مطالعات بیولوژی و بیواکولوژی انجام می پذیرد. از جمله فعالیتهای دیگر این بخش  بررسی نقش دشمنان طبیعی آفات کلیدی در زراعت پنبه و توسعه روشهای افزایش کارایی دشمنان طبیعی بعنوان جزء اساسی در برنامه مدیریت تلفیقی آفات پنبه (IPM) می باشد. در زمینه بیماریها  نیز به حداقل رساند آسیب رسانی آنها زیر آستانه اقتصادی و ارزیابی ژنتیکـی مقاومـت ارقـام به بیماریها از جمله دیگر رئوس تحقیقاتی این بخش است